据我了解澳大利亚的学校是一年两次开课，那么我明年本科毕业，衔接上的就是秋季课程，那么请问两次开课有主次之分吗？课程设置有不同吗？对我会有影响吗？

是的，除去某些大学的个别专业外，澳洲大学，硕士课程大多为一年两次开课的，大约都集中在每年的2月和7月，并没有主次之分，同一所大学相同专业的课程设置也是完全一样的，没有主要招生和补录招生的区别，都是并行的，只是一年两次开学机会而已，中国学生申请时完全不需要有顾虑。